Il Museo è in pieno centro storico, con accesso dal portico del Pavaglione, che costeggia Piazza Maggiore e la chiesa di San Petronio.
- in autobus: tutti gli autobus di linea che effettuano la fermata in prossimità di Piazza Maggiore
- in auto: situato in Zona a Traffico Limitato. Uscite tangenziale più vicine n. 11/11bis-12, direzione centro. Parcheggi a pagamento più vicini: Piazza VIII Agosto (10 min. a piedi) e Parcheggio Staveco (15 min. a piedi).
- a piedi: dalla stazione FF.SS. e dall’Autostazione raggiungere Via dell’Indipendenza fino in Piazza Maggiore, e da qui dirigersi a sinistra sotto il portico del Pavaglione, dove si trova l’ingresso del Museo (circa km 1,5).
Dall’aeroporto: navetta BLQ, fermata via indipendenza-San Pietro.